Mengambil jurusan Sarjana Muda Pengajian Islam UKM dan Diploma Pendidikan UTM. Mustaffa adalah Pendidik di MRSM Kuala Terengganu, Kolej MARA Kulim, MRSM Terendak dan MRSM Serting.
Mustaffa juga pernah menjadi Timbalan Pengetua MRSM Kula Kubu Baru dan MRSM Batu Pahat. (penerima Anugerah Perkhidmatan Cemerlang MARA). Mustaffa juga pengerusi dan Imam Surau Tunku Besar Mukhriz.